Servei de proteòmica i genòmica

Proteòmica

  • Separació de proteïnes mitjançant electroforesi monodimensional (SDS-PAGE)
  • Separació de mostres complexes de proteïnes en funció del seu pI (Isoelectroenfoc, IEF)
  • Separació de mostres complexes de proteïnes mitjançant electroforesi bidimensional (2D-PAGE)
  • Immunodetecció de proteïnes de gels mono i bidimensionals (Western blot)
  • Anàlisi proteòmic d'alt rendiment plataforma Olink Reveal

Genòmica

  • Anàlisi quantitatiu i qualitatiu (integritat) d’àcids nucleics
  • Amplificació automàtica d’ADN (PCR)
  • Seqüenciació d’ADN per electroforesi capil·lar automàtica (Seqüenciació Sanger)
  • Seqüenciació massiva: segona i tercera generació (short-read/long-read)
  • Anàlisi de fragments d’ADN per electroforesi capil·lar automàtica
  • Quantificació absoluta i relativa de mRNA per PCR en temps real
  • Discriminació al·lelica per PCR en temps real
  • Variació gènica per PCR en temps real
  • Anàlisi d'ADN (genotipat d'SNPs) per espectrometria de masses MALDI-TOF
  • PCR digital (quantificació absoluta/relativa d'àcids nucleics, variació gènica, mutacions, etc.)
  • Lectura de microarrays d'ADN, proteïnes, teixits

Lipidòmica

Els objectius d'aquesta plataforma són els següents:

1. Detectar, identificar i quantificar la totalitat de les especies lipídiques d'un sistema (cèl·lules, teixits, òrgans, aliments, etc...)

2. Definir perfils lipídics en condicions fisiològiques i patològiques

3. Identificar nous biomarcadors lipídics


Podeu accedir a tota la informació a l'Adreça web del Servei.

Proteòmica

  • Plataforma proteòmica d'alt rendiment Olink Reveal

 

També es disposa d'instrumentació bàsica per a la preparació de mostres prèvia al seu anàlisi amb aquests equips.

Genòmica

  • Sonicador Bioruptor Pico
  • Robot pipetejador Assist Plus
  • Analitzador genètic GA3130 amb softwares d’anàlisi Data Collection v 3.0, Sequencing Analysis v 5.3.1, SeqScape v 2.6 i GeneMapper v 4.0
  • Sistema de PCR en temps real QuantStudio 6 Pro amb softwares d'anàlisi Diomni Design and Analysis (DA3)
  • Escàner de microarrays Axon Gene Pix 4100A amb softwares d’anàlisi GenPix Pro v 5.1. i Acuity v 3.0
  • Seqüenciador de tercera generació MinIon d'Oxford Nanopore Technologies

 

També es disposa d'instrumentació bàsica per a la preparació de mostres prèvia al seu anàlisi amb aquests equips.

Proteòmica

Aplicacions principals en l’àrea de la Proteòmica

  • Quantificació de proteïnes per Western blot
  • Separació de proteïnes en gels bidimensionals
  • Proteòmica d'alt rendiment Olink Reveal: plataforma de proteòmica humana basada en la tecnologia d'assaig d'extensió de proximitat (PEA) amb lectures de seqüenciació de nova generació (NGS), que permet l'anàlisi simultània de 1034 dianes proteiques en 86 mostres, a partir de tan sols 4 µL de mostra.

Genòmica

Aplicacions principals en l’àrea de la Genòmica

  • Anàlisi de la integritat (qualitat) de l’ARN per aplicacions de PCR en temps real, PCR digital o microarrays
  • Seqüenciació automàtica d’ADN:  recerca de mutacions, verificació de clonatges, reseqüenciació, ...
  • Seqüenciació massiva d'àcids nucleics (NGS)
  • Estudis de genotipatge basats en diferents marcadors moleculars (SNPs, AFLP, RFLP, LOH, microsatèl·lits) mitjançant diferents metodologies d’anàlisi: electroforesi capilar automàtica, PCR en temps real (genotipat d´SNPs per discriminació al·lèlica), PCR digital
  • Anàlisi de variació gènica per MLPA o PCR en temps real/digital
  • Estudis d’expressió gènica mitjançant tècniques de PCR en temps real, PCR digital o microarrays
  • Validació de resultats de microarrays i proteòmica diferencial per PCR en temps real
  • Genotipat d´SNPs per espectrometria de masses MALDI-TOF
  • Estudis d’expressió proteica utilitzant microarrays d’anticossos
  • Detecció i quantificació de microorganismes i d'OGMs
  • Determinació de la càrrega viral
  • Anàlisi de microRNAs

Director del Servei

Dr. Joaquim Ros

Correu electrònic:

joaquim.ros@udl.cat

Responsable científic genòmica

Dr. Eloi Garí

Correu electrònic:

eloi.gari@udl.cat

Tècnic de suport

Isabel Sánchez

Correu electrònic:

isabel.sanchez@udl.cat

Telèfon: +34 973 70 24 77

Adreça

Campus Ciències de la Salut 
Edifici Biomedicina, mòdul 2, 4a planta, 4-7. 
C/ Rovira Roure, 80, CP 25198, Lleida 

Horari
De dilluns a dimecres, de 8:30 a 16:30 hores. Dijous, de 08.30 a 16.00 hores. Divendres, de 08.30 a 14.00 hores.
Telèfon
+34 973 70 24 77

Horari lliurament de mostres: de dilluns a divendres, de 9:00 a 15:00.

   Darrera modificació: